Le typhon a touché vers 23H00 locales (15H00 GMT) Sorgoson, dans le sud de l'île de Luçon, ont indiqué les services météorologiques PAGASA.
Luçon, qui est la plus grande île des Philippines, compte 49 millions d'habitants.
Le typhon devrait ensuite passer au sud de Manille, la capitale peuplée de 13 millions d'habitants, et qui accueille des milliers d'athlètes pour les Jeux d'Asie du Sud-Est, dont des épreuves ont dû être annulées. Il devrait ensuite partir par le nord-ouest des Philippines mercredi.
Le vent atteignait 175 km/h à l'arrivée du typhon sur les Philippines, avec des rafales allant jusqu'à 240 khm/h. Les météorologues prévoient également d'intenses précipitations.
Près de 70.000 personnes ont déjà fui leurs habitations dans la région de Bicol, qui devait être la première touchée, ont indiqué les services d'urgence philippins, et des milliers d'entre elles ont depuis dimanche trouvé refuge dans des écoles et des gymnases.
Dans certaines villes, des écoles ont été fermées et les fonctionnaires invités à ne pas travailler lundi et mardi.
Mais des habitants ont toutefois décidé de rester, malgré des vents gagnant en puissance.
"Le vent hurle. Les toîts commencent à se plier et j'en ai vu un s'envoler", a raconté à l'AFP une habitante de la région de Bicol, Gladys Castillo Vidal. "Nous avons décidé de rester parce que notre maison de deux étages est en ciment. Avec de la chance, elle pourra résister".
Les services météo redoutent aussi des coulées de boue et de possibles montées de eaux atteignant jusqu'à trois mètres dans les régions côtières les plus affectées.
Haiyan, typhon le plus dévastateur
"Les compagnies aériennes et les autorités ont décidé de fermer l'aéroport" international de Manille, a affirmé lundi à la presse son directeur, Ed Monreal. Le trafic devrait être suspendu mardi entre 11 heures du matin (03H00 GMT) à 11 heures du soir locales (15H00 GMT).
Les Philippines sont touchées par une vingtaine de tempêtes et typhons en moyenne chaque année, qui font des centaines de morts et maintiennent des populations entières dans les régions les plus exposées dans une situation de pauvreté constante. Le typhon le plus dévastateur enregistré dans le pays, Haiyan, a fait plus de 7.300 morts et disparus en 2013.
Des vents violents avaient commencé d'affecter l'archipel philippin samedi soir, peu avant le lancement de la cérémonie d'ouverture des Jeux d'Asie du Sud-Est par le président Rodrigo Duterte et la star de la boxe Manny Pacquiao.
Ces Jeux doivent se dérouler jusqu'au 11 décembre dans trois villes de Luçon -- Clark, Manille et Subic-- avec 56 disciplines représentées et des épreuves prévues dans des dizaines de sites différents.
Quelque 8.750 athlètes et membres des délégations sont annoncés, de même qu'environ 12.000 bénévoles. Les organisateurs prévoient plus de 500 millions de téléspectateurs d'ici la fin des Jeux.
Les épreuves en extérieur prévues à Subic, sur la côte ouest, ont subi des changements.
"Le windsurf a été annulé jusqu'à ce que nous ayons une image plus précise de la météo", a déclaré à l'AFP Ramon Agregado, un responsable du comité d'organisation. D'autres épreuves, comme le triathlon, ont été déplacées ou avancées.
Selon Ramon Suzara, un autre responsable des Jeux, des plans alternatifs d'urgence sont en place mais la durée de la compétition ne devrait pas être allongée. "Tout est prêt" pour adapter les épreuves aux conditions climatiques, a-t-il assuré à la presse.
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