Le coureur de 22 ans, a pris la quatrième place de cette étape raccourcie de 59 kilomètres en raison des conditions climatiques difficiles et devrait devenir dimanche le premier Colombien sacré sur le Tour et l'un des plus jeunes vainqueurs de l'épreuve.
La dernière étape de montagne a sorti du podium Julian Alaphilippe, qui occupait au départ la deuxième place du Tour. Le Français, maillot jaune encore la veille, a cédé dans les 14 derniers kilomètres et a reculé à la 5e place du classement.
L'équipe Ineos place donc deux coureurs tout en haut de la hiérarchie avec le vainqueur sortant, le Gallois Geraint Thomas, deuxième.
A l'altitude de 2365 mètres, l'une des plus hautes dans l'histoire de l'épreuve, Nibali a remporté un succès de grand prestige, son sixième dans le Tour dont il a enlevé le classement général en 2014.
Avant la dernière étape, une formalité de 128 kilomètres entre Rambouillet et Paris, Bernal compte une marge de 1 min 11 sec sur Thomas, qui l'a étreint sur la ligne d'arrivée.
L'équipe Jumbo (Bennett, De Plus) a durci la course dès les premières rampes de l'interminable montée de Val Thorens, 33,4 kilomètres à 5,5 % de pente, pour permettre à son chef de file, le Néerlandais Steven Kruijswijk, de monter sur le podium, à la troisième place.
A l'avant, les rescapés (Gallopin, Nibali, Périchon, Woods, Zakarin) d'une échappée lancée peu après le départ ont longtemps gardé l'avantage, qui s'élevait à 2 minutes et demie au pied de l'ascension.
Nibali, seul en tête à 13 kilomètres de l'arrivée, a tenu bon jusqu'au bout. Le "Requin de Messine", deuxième du dernier Giro, a résisté aux contre-attaquants (S. Yates, Barguil, Soler, Quintana) qui se sont épuisés derrière lui.
Le Sicilien, qui est âgé de 34 ans, a précédé sur la ligne le champion du monde, l'Espagnol Alejandro Valverde (39 ans). Un autre Espagnol, Mikel Landa, a pris la troisième place.
Le Français Romain Bardet, 27e de l'étape, a conservé le maillot à pois de meilleur grimpeur.
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